123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748495051525354555657585960616263646566676869707172737475767778798081828384858687888990919293949596979899100101102103104105106107108109110111112113114115116117118119120121122123124125126127128129130131132133134135136137138139140141142143144145146147148149150151152153154155156157158159160161162163164165166167168169170171172173174175176177178179180181182183184185186187188189190191192193194195196197198199200201202203204205206207208209210211212213214215216217218219220221222223224225226227 |
- % ImageDisplay
- global Exp
- global ghandles
- global zonePB
- prntHt=0;
- % Test for Bad MP cell array (usually 384 [NaN}'s)
- % replaced length(Exp(expN).Dexp(1).MP) with MPnum
- for mx=1:length(Exp(expN).Dexp(1).MP)
- try
- char((Exp(expN).Dexp(1).MP(mx).genename{1}(384)))
- MPnum=mx;
- catch
- break
- end
- end
- if expN==1,DexpN=(get(handles.DN1,'value')); end
- if expN==2,DexpN=(get(handles.DN2,'value')); end
- if expN==3,DexpN=(get(handles.DN3,'value')); end
- Exp(expN).DexpN=DexpN;
- if strcmp(Exp(expN).DexpType,'single')
- DexpN=1;
- elseif ~strcmp(Exp(expN).DexpType,'single')
- if expN==1
- set(handles.MPsldr1,'min',1,'max',MPnum)
- DMnum=length(Exp(expN).Dexp(DexpN).DM.drug);
- set(handles.DMsldr1,'min',1,'max',DMnum)
- tPtsSize=size(Exp(expN).Dexp(DexpN).FexpScanBMtp{1,1},(3));
- set(handles.Tptsldr1,'min',1,'max',tPtsSize)
- end
- if expN==2
- set(handles.MPsldr2,'min',1,'max',MPnum)
- DMnum=length(Exp(expN).Dexp(DexpN).DM.drug);
- set(handles.DMsldr2,'min',1,'max',DMnum)
- tPtsSize=size(Exp(expN).Dexp(DexpN).FexpScanBMtp{1,1},(3));
- set(handles.Tptsldr2,'min',1,'max',tPtsSize)
- end
- if expN==3
- set(handles.MPsldr3,'min',1,'max',MPnum)
- DMnum=length(Exp(expN).Dexp(DexpN).DM.drug);
- set(handles.DMsldr3,'min',1,'max',DMnum)
- tPtsSize=size(Exp(expN).Dexp(DexpN).FexpScanBMtp{1,1},(3));
- set(handles.Tptsldr3,'min',1,'max',tPtsSize)
- end
- end
- ghandles=handles;
- scan=Exp(expN).Dexp(DexpN).scan;
- destPerMP=length(Exp(expN).Dexp(DexpN).DM.drug);
-
- if expN==1,MPsel=floor(get(handles.MPsldr1,'value')); end
- if expN==2,MPsel=floor(get(handles.MPsldr2,'value')); end
- if expN==3,MPsel=floor(get(handles.MPsldr3,'value')); end
- if expN==1,pertSel=floor(get(handles.DMsldr1,'value')); end
- if expN==2,pertSel=floor(get(handles.DMsldr2,'value')); end
- if expN==3,pertSel=floor(get(handles.DMsldr3,'value')); end
- if expN==1,tPtSel=floor(get(handles.Tptsldr1,'value')); end
- if expN==2,tPtSel=floor(get(handles.Tptsldr2,'value')); end
- if expN==3,tPtSel=floor(get(handles.Tptsldr3,'value')); end
- plateNum=(MPsel-1)*destPerMP + pertSel;
- tPtsSize=[];
- tPtsSize=length(Exp(expN).Dexp(DexpN).scan(plateNum).plate(1).tSeries(:))
- n=1;
- for ii=1:tPtsSize
- if exist(fullfile(Exp(expN).Dexp(DexpN).ExpFoldr,num2str(plateNum),strcat((num2str(ii)),'.bmp'))) ==2; %the .bmp file exists
- bmpLst(n)=ii
- n=n+1
- end
- end
- if tPtSel> tPtsSize
- tPtSel=tPtsSize
- end
- if exist(fullfile(Exp(expN).Dexp(DexpN).ExpFoldr,num2str(plateNum),strcat((num2str(tPtSel)),'.bmp'))) ==0; %the .bmp file exists
- tPtSel=bmpLst(find(bmpLst>tPtSel,1,'first'))
- end
-
- if expN==1,
- set(handles.Tptsldr1,'max',tPtsSize);
- set(ghandles.Tptsldr1,'max',tPtsSize);
- set(handles.Tpted1,'string', num2str(tPtSel));
- set(ghandles.Tpted1,'string', num2str(tPtSel));
- if tPtsSize<=tPtSel,
- set(handles.Tptsldr1,'value', tPtsSize)
- set(ghandles.Tptsldr1,'value', tPtsSize)
- tPtSel=tPtsSize
- set(handles.Tpted1,'string', num2str(tPtsSize))
- set(ghandles.Tpted1,'string', num2str(tPtsSize))
- end
- end
- if expN==2
- set(handles.Tptsldr2,'max',tPtsSize);
- set(ghandles.Tptsldr2,'max',tPtsSize);
- set(handles.Tpted2,'string', num2str(tPtSel));
- set(ghandles.Tpted2,'string', num2str(tPtSel));
- if tPtsSize<=tPtSel,
- set(handles.Tptsldr2,'value', tPtsSize)
- set(ghandles.Tptsldr2,'value', tPtsSize)
- tPtSel=tPtsSize
- set(handles.Tpted2,'string', num2str(tPtsSize))
- set(ghandles.Tpted2,'string', num2str(tPtsSize))
- end
- end
- if expN==3
- set(handles.Tptsldr3,'max',tPtsSize);
- set(ghandles.Tptsldr3,'max',tPtsSize);
- set(handles.Tpted3,'string', num2str(tPtSel));
- set(ghandles.Tpted3,'string', num2str(tPtSel));
- if tPtsSize<=tPtSel,
- set(handles.Tptsldr3,'value', tPtsSize)
- set(ghandles.Tptsldr3,'value', tPtsSize)
- tPtSel=tPtsSize
- set(handles.Tpted3,'string', num2str(tPtsSize))
- set(ghandles.Tpted3,'string', num2str(tPtsSize))
- end
- end
- Exp(expN).Dexp(DexpN).MPsel=MPsel;
- Exp(expN).Dexp(DexpN).destPerMP=destPerMP;
- Exp(expN).Dexp(DexpN).pertSel=pertSel;
- Exp(expN).Dexp(DexpN).tPtSel=tPtSel;
- Exp(expN).Dexp(DexpN).plateNum=plateNum;
- %try
- I=imread(fullfile(Exp(expN).Dexp(DexpN).ExpFoldr,num2str(plateNum),strcat(num2str(tPtSel),'.bmp')));
- %set(ghandles.Iaxes1,'CurrentAxes')
- if expN==1, expAxes=ghandles.Iaxes1;end
- if expN==2, expAxes=ghandles.Iaxes2;end
- if expN==3, expAxes=ghandles.Iaxes3;end
- axes(expAxes)
- imshow(I)
- set(expAxes,'xtick',[],'ytick',[])
- DMstr=char(strcat('Agar-',Exp(expN).Dexp(DexpN).DM.media{pertSel},' ', ...
- Exp(expN).Dexp(DexpN).DM.drug{pertSel},Exp(expN).Dexp(DexpN).DM.conc{pertSel},' ', ...
- Exp(expN).Dexp(DexpN).DM.mod1{pertSel},Exp(expN).Dexp(DexpN).DM.conc1{pertSel},' ', ...
- Exp(expN).Dexp(DexpN).DM.mod2{pertSel},Exp(expN).Dexp(DexpN).DM.conc2{pertSel}))
- if expN==1,set(handles.DM1,'string',DMstr); end
- if expN==2,set(handles.DM2,'string',DMstr); end
- if expN==3,set(handles.DM3,'string',DMstr); end
- tPtStr=strcat('T=', num2str(scan(1,plateNum).plate(1).t0Series(tPtSel)));
- if expN==1,set(handles.tptTm1,'string',tPtStr); end
- if expN==2,set(handles.tptTm2,'string',tPtStr); end
- if expN==3,set(handles.tptTm3,'string',tPtStr); end
- xp=char(Exp(expN).Dexp(DexpN).resDir);
- if ispc
- slashPos=strfind(char(Exp(expN).Dexp(DexpN).resDir),'\');
- else
- slashPos=strfind(char(Exp(expN).Dexp(DexpN).resDir),'/');
- end
- startPos=slashPos(length(slashPos)-2) +1;
- endPos=(slashPos(length(slashPos)) -1);
- expStrg=xp(startPos:end);
-
- if expN==1,set(handles.expName1,'string',expStrg); end
- if expN==2,set(handles.expName2,'string',expStrg); end
- if expN==3,set(handles.expName3,'string',expStrg); end
-
- try
- htMapTogPBfg=0;
- EZhtMap
- catch
- end
- % zonePB handle control from left graph spot side to communicate to right side 23_0818
- % This section was based on the zoneRad Section for Radiobuttons which were
- % unusable with the new form of Radio Buttons in AppDesigner.
- if expN==1
- zonesel=1;
- zonePB=1;
- set(handles. zonePB1,'value',1)
- set(handles. zonePB2,'value',0)
- set(handles. zonePB3,'value',0)
- set(handles.zonePB1,'BackgroundColor',[1.0 0.6 0.6])
- set(handles.zonePB2,'BackgroundColor',[1.0 1.0 1.0])
- set(handles.zonePB3,'BackgroundColor',[1.0 1.0 1.0])
- orfLstSel=get(handles.GeneOrfTog,'value');
- if orfLstSel==1
- set(handles.listboxGnOrf,'string',Exp(1).Dexp(DexpN).srtOrfLst)
- else
- set(handles.listboxGnOrf,'string',Exp(1).Dexp(DexpN).srtGnLst)
- end
- end
- if expN==2
- zonesel=2;
- zonePB=2;
- set(handles. zonePB2,'value',1)
- set(handles. zonePB1,'value',0)
- set(handles. zonePB3,'value',0)
- set(handles.zonePB2,'BackgroundColor',[1.0 0.6 0.6])
- set(handles.zonePB1,'BackgroundColor',[1.0 1.0 1.0])
- set(handles.zonePB3,'BackgroundColor',[1.0 1.0 1.0])
- orfLstSel=get(handles.GeneOrfTog,'value');
- if orfLstSel==1
- set(handles.listboxGnOrf,'string',Exp(2).Dexp(DexpN).srtOrfLst)
- else
- set(handles.listboxGnOrf,'string',Exp(2).Dexp(DexpN).srtGnLst)
- end
- end
- if expN==3
- zonesel=3;
- zonePB=3;
- set(handles. zonePB3,'value',1)
- set(handles. zonePB2,'value',0)
- set(handles. zonePB1,'value',0)
- set(handles.zonePB3,'BackgroundColor',[1.0 0.6 0.6]);
- set(handles.zonePB1,'BackgroundColor',[1.0 1.0 1.0]);
- set(handles.zonePB2,'BackgroundColor',[1.0 1.0 1.0]);
- orfLstSel=get(handles.GeneOrfTog,'value');
- if orfLstSel==1
- set(handles.listboxGnOrf,'string',Exp(3).Dexp(DexpN).srtOrfLst)
- else
- set(handles.listboxGnOrf,'string',Exp(3).Dexp(DexpN).srtGnLst)
- end
- end
-
-
-
|